การกลายพันธุ์ในตัวแปร Epsilon มีส่วนทำให้เกิดการหลีกเลี่ยงภูมิคุ้มกัน SARS-CoV-2

การกลายพันธุ์สามครั้งในโปรตีนขัดขวาง Epsilon coronavirus ทำให้ศักยภาพในการต่อต้านแอนติบอดีที่เกิดจากวัคซีนปัจจุบันหรือการติดเชื้อ COVID ในอดีตลดลง บาคาร่า

การกลายพันธุ์ทำให้เกิดความกังวลเกี่ยวกับไวรัสโคโรน่าสายพันธุ์นี้ในการหลีกเลี่ยงโมโนโคลนอลแอนติบอดีจำเพาะที่ใช้ในคลินิกโดยสิ้นเชิง และลดประสิทธิภาพของแอนติบอดีจากพลาสมาของผู้ที่ได้รับวัคซีน

เพื่อให้เข้าใจกลยุทธ์การหลบหนีของภูมิคุ้มกันที่แท้จริงในที่ทำงานได้ดียิ่งขึ้น นักวิทยาศาสตร์ได้เห็นภาพกลไกการติดเชื้อของตัวแปรนี้ เพื่อดูว่าอะไรแตกต่างจากการกำหนดค่าดั้งเดิมของ coronavirus ที่ระบาดใหญ่ และความหมายของการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้คืออะไร

โครงการระดับนานาชาตินี้นำโดยห้องปฏิบัติการของ David Veesler ในภาควิชาชีวเคมีที่มหาวิทยาลัย Washington ในซีแอตเทิล และโดย Luca Piccoli และ Davide Corti จาก Vir Biotechnology

หลายปีที่ผ่านห้องปฏิบัติการ Veesler และทำงานร่วมกันที่ได้รับการสำรวจโครงสร้างโมเลกุลและการติดเชื้อของโรคซาร์สกลศาสตร์เหมือนcoronaviruses พวกเขายังตรวจสอบว่าแอนติบอดีพยายามปิดกั้นกลไกการติดเชื้ออย่างไร และรูปแบบต่างๆ เกิดขึ้นได้อย่างไรกับการหลบหลีกแบบใหม่

ข้อมูลล่าสุดของพวกเขาแสดงให้เห็นว่าตัวแปร Epsilon "อาศัยกลยุทธ์การหลบหนีการวางตัวเป็นกลางทางอ้อมและผิดปกติ" ตามที่นักวิจัยกล่าว บาคาร่า

การค้นพบของพวกเขาจะตีพิมพ์เป็นกระดาษที่วางจำหน่ายครั้งแรกในวิทยาศาสตร์

การวิเคราะห์นาฬิกาโมเลกุลจับเวลาการเกิดขึ้นของสารตั้งต้นของตัวแปรเอปไซลอนจนถึงเดือนพฤษภาคมปี 2020 ในแคลิฟอร์เนีย ในช่วงฤดูร้อนปี 2020 ได้แยกออกเป็นสายเลือด B.1.427/B.1.429 กรณีของ COVID จากตัวแปรเพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็ว และในไม่ช้าตัวแปรก็แพร่หลายในสหรัฐอเมริกา ขณะนี้มีรายงานในประเทศอื่นๆ อย่างน้อย 34 ประเทศ

เพื่อเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับลักษณะของตัวแปรเอปไซลอน นักวิจัยได้ทดสอบความยืดหยุ่นกับพลาสมารุ่นเอปไซลอนจากผู้ที่ได้รับเชื้อไวรัสและคนที่ได้รับวัคซีน ศักยภาพในการทำให้เป็นกลางของพลาสมาเทียบกับตัวแปร Epsilon ที่น่ากังวลลดลงประมาณ 2 ถึง 3.5 เท่า บาคาร่า

การแสดงภาพการกลายพันธุ์เหล่านี้ช่วยอธิบายได้ว่าทำไมแอนติบอดีจึงจับยากกับสไปค์ไกลโคโปรตีน

หนึ่งในสามการกลายพันธุ์ในแวเรียนต์ Epsilon ส่งผลต่อโดเมนการจับตัวรับบนสไปค์ไกลโคโปรตีน การกลายพันธุ์นี้ลดฤทธิ์การทำให้เป็นกลางของแอนติบอดีที่เป็นกลาง 14 จาก 34 ตัวที่จำเพาะต่อโดเมนนั้น ซึ่งรวมถึงแอนติบอดีระยะทางคลินิก

การกลายพันธุ์อีกสองในสามในแวเรียนต์ส่งผลต่อโดเมนปลาย N บนสไปค์ไกลโคโปรตีน นักวิจัยใช้แมสสเปกโตรเมทรีและการวิเคราะห์โครงสร้างเพื่อค้นหาว่าส่วนหนึ่งของโดเมน coronavirus N-terminal ได้รับการออกแบบใหม่โดยการกลายพันธุ์เหล่านี

ตำแหน่งการตัดแยกของเปปไทด์สัญญาณถูกเลื่อนในซูเปอร์ไซต์แอนติเจน NTD และพันธะไดซัลไฟด์ใหม่ถูกสร้างขึ้น สิ่งนี้ส่งผลให้สูญเสียการทำให้เป็นกลางโดย 10 จาก 10 แอนติบอดีที่ทดสอบจำเพาะกับโดเมนปลาย N ในสไปค์ไกลโคโปรตีน

นักวิทยาศาสตร์เชื่อว่าการเปิดเผยกลไกของการหลีกเลี่ยงภูมิคุ้มกัน เช่น กลไกที่เพิ่งค้นพบนี้โดยอาศัยการดัดแปลงสัญญาณเปปไทด์ มีความสำคัญพอๆ กับการเฝ้าระวังตัวแปรผ่านการจัดลำดับอาร์เอ็นเอ พวกเขาทราบดีว่าความพยายามดังกล่าวสามารถช่วยรับมือกับการแพร่ระบาดที่กำลังดำเนินอยู่ได้สำเร็จ